
GRANADA 2012
V rámci projektu Školské partnerstvá COMENIUS – „New European Challenges in Life Sciences: „The Game of Proteins““ sme sa v dňoch od 16.4. do 21.4.2012 zúčastnili posledného žiackeho projektového stretnutia. Stretnutie pripravila škola I.E.S. AYNADAMAR z Granady. Na projekte participuje 11 škôl z 10 krajín: Nemecko (Hamburg, Pforzheim), Francúzsko (Évreux), Španielsko (Granada), Rakúsko (Viedeň), Česká republika (Brno), Maďarsko (Miškolc), Chorvátsko (Osijek), Litva (Vilnius), Lotyšsko (Riga) a Slovensko v zastúpení Gymnázia sv. Františka Assiského z Levoče.
Stretnutie bolo zamerané na tri úlohy týkajúce sa bielkovín:
1. ELISA-HIV test
2. Purifikácia GFP pomocou stĺpcovej chromatografie
3. Elektroforéza SDS-PAGE proteínu GFP
Prvý experiment opisoval význam detekcie protilátok (bielkovín) v krvi ľudí, z dôvodu ďalšieho šírenie infekčných ochorení ako je napr. HIV/AIDS, západonílsky vírus (WNV), SARS, atď. Existuje stav, kedy človek je prenášačom ochorenia, pričom sám neprejavuje príznaky ochorenia – bacilonosič alebo v prípade ľudí infikovaných HIV, u ktorých sa ochorenie AIDS prejaví až o niekoľko rokov a tak sami môžu vírusom HIV infikovať ďalších. ELISA (Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay) test je postavený na jednoduchom princípe výstavby tzv. sendvičovej štruktúry, kedy po jej zostavení, samozrejme za prítomnosti protilátok proti HIV dôjde k farebnej zmene, ktorá indikuje prítomnosť vírusu v tele. Jedná sa o jednoduchú katalyzovanú reakciu s farebným výsledkom, v prípade pozitivity na prítomnosť antigénu. Táto úloha sa tešila veľkému záujmu žiakov i vyučujúcich.
Ďalšie dve úlohy na seba nadväzovali. V prvom rade bola našou úlohou purifikovať (izolovať, očistiť) proteín GFP z bakteriálneho lyzátu E.coli (baktérií geneticky modifikovaných, ktoré obsahovali gén pre GFP pôvodne pochádzajúceho z medúzy Aequorea victoria). V priebehu stĺpcovej chromatografie dochádza k naviazaniu GFP proteínu zo zmesi proteínov lyzátu na ligand prítomný v stacionárnej fáze chromatografickej kolóny, čím sa oddelí od ostatných. Následným krokom je ho možné uvoľniť pomocou látky, ktorá má vyššiu afinitu k ligandu ako on sám. Po jeho purifikácii nasledovala metóda na zisťovanie jeho molekulovej hmotnosti pomocou SDS-PAGE elektroforézy, kedy elektroneutrálne molekuly GFP získavajú záporný náboj, čím sú schopné putovať v elektrickom poli v géli. Následne pomocou kaleidoskopového štandardu (zmesi známych proteínov) a vzdialenosti akú preputuje v géli je možné určiť jeho molekulovú hmotnosť.
Účastníci stretnutia boli v priebehu experimentov rozdelení do medzinárodných skupiniek. Ich prácu koordinovali vopred vyškolení mentori pod vedením učiteľov zo školy Johanna Wittum Schule z Pforzheimu a učiteľov z I.E.S. Aynadamar z Granady.
Naši hostitelia nám vyplnili voľné chvíle v podobe spoznávania krás Granady, pevnosti Alhambra, ktorá sa vypína storočia nad Granadou, taktiež sme navštívili oblasť El Ejido posiatou množstvom skleníkov a samozrejme nám nezabudli ukázať krásy španielského pobrežia v oblasti národného parku Cabo de Gata.
RNDr. Lucia Bizoňová
V rámci projektu Školské partnerstvá COMENIUS – „New European Challenges in Life Sciences: „The Game of Proteins““ sme sa v dňoch od 16.4. do 21.4.2012 zúčastnili posledného žiackeho projektového stretnutia. Stretnutie pripravila škola I.E.S. AYNADAMAR z Granady. Na projekte participuje 11 škôl z 10 krajín: Nemecko (Hamburg, Pforzheim), Francúzsko (Évreux), Španielsko (Granada), Rakúsko (Viedeň), Česká republika (Brno), Maďarsko (Miškolc), Chorvátsko (Osijek), Litva (Vilnius), Lotyšsko (Riga) a Slovensko v zastúpení Gymnázia sv. Františka Assiského z Levoče.
Stretnutie bolo zamerané na tri úlohy týkajúce sa bielkovín:
1. ELISA-HIV test
2. Purifikácia GFP pomocou stĺpcovej chromatografie
3. Elektroforéza SDS-PAGE proteínu GFP
Prvý experiment opisoval význam detekcie protilátok (bielkovín) v krvi ľudí, z dôvodu ďalšieho šírenie infekčných ochorení ako je napr. HIV/AIDS, západonílsky vírus (WNV), SARS, atď. Existuje stav, kedy človek je prenášačom ochorenia, pričom sám neprejavuje príznaky ochorenia – bacilonosič alebo v prípade ľudí infikovaných HIV, u ktorých sa ochorenie AIDS prejaví až o niekoľko rokov a tak sami môžu vírusom HIV infikovať ďalších. ELISA (Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay) test je postavený na jednoduchom princípe výstavby tzv. sendvičovej štruktúry, kedy po jej zostavení, samozrejme za prítomnosti protilátok proti HIV dôjde k farebnej zmene, ktorá indikuje prítomnosť vírusu v tele. Jedná sa o jednoduchú katalyzovanú reakciu s farebným výsledkom, v prípade pozitivity na prítomnosť antigénu. Táto úloha sa tešila veľkému záujmu žiakov i vyučujúcich.
Ďalšie dve úlohy na seba nadväzovali. V prvom rade bola našou úlohou purifikovať (izolovať, očistiť) proteín GFP z bakteriálneho lyzátu E.coli (baktérií geneticky modifikovaných, ktoré obsahovali gén pre GFP pôvodne pochádzajúceho z medúzy Aequorea victoria). V priebehu stĺpcovej chromatografie dochádza k naviazaniu GFP proteínu zo zmesi proteínov lyzátu na ligand prítomný v stacionárnej fáze chromatografickej kolóny, čím sa oddelí od ostatných. Následným krokom je ho možné uvoľniť pomocou látky, ktorá má vyššiu afinitu k ligandu ako on sám. Po jeho purifikácii nasledovala metóda na zisťovanie jeho molekulovej hmotnosti pomocou SDS-PAGE elektroforézy, kedy elektroneutrálne molekuly GFP získavajú záporný náboj, čím sú schopné putovať v elektrickom poli v géli. Následne pomocou kaleidoskopového štandardu (zmesi známych proteínov) a vzdialenosti akú preputuje v géli je možné určiť jeho molekulovú hmotnosť.
Účastníci stretnutia boli v priebehu experimentov rozdelení do medzinárodných skupiniek. Ich prácu koordinovali vopred vyškolení mentori pod vedením učiteľov zo školy Johanna Wittum Schule z Pforzheimu a učiteľov z I.E.S. Aynadamar z Granady.
Naši hostitelia nám vyplnili voľné chvíle v podobe spoznávania krás Granady, pevnosti Alhambra, ktorá sa vypína storočia nad Granadou, taktiež sme navštívili oblasť El Ejido posiatou množstvom skleníkov a samozrejme nám nezabudli ukázať krásy španielského pobrežia v oblasti národného parku Cabo de Gata.
RNDr. Lucia Bizoňová